直系亲属之间输血存在诸多医学风险。由于直系亲属的基因相似度较高，当供血者的血液输入受血者体内后，供血者血液中的免疫细胞，因为与受血者免疫细胞的差异较小，不易被受血者免疫系统及时识别和清除，这些免疫细胞便可能在受血者体内存活、增殖。随后，它们会将受血者的组织器官识别为“外来物”进行攻击 ，引发发热、皮疹、肝功能异常等严重症状，这一现象被称为输血相关性移植物抗宿主病（TA-GVHD）。该病致死率极高，一旦发生，治疗难度极大。
此外，直系亲属间输血还可能引发免疫排斥反应。例如急性溶血性输血反应，这种反应会致使红细胞破裂，进而使受血者出现高热、寒战、心悸等严重症状。由于直系亲属之间抗原差异较小，受血者的免疫系统难以有效识别血液中潜藏的病原体，如肝炎病毒、HIV等，从而增加感染风险。
